คณะมนุษยศาสตร์ เป็นคณะฯ หนึ่งในมหาวิทยาลัยนเรศวร เกิดขึ้นจากการรวมคณะมนุษยศาสตร์และคณะสังคมศาสตร์ มหาวิทยาลัยศรีนครินทร์วิโรฒ วิทยาเขตพิษณุโลก เข้าด้วยกันในปี พ.ศ.2533 เมื่อมหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ วิทยาเขตพิษณุโลกได้รับการยกฐานะเป็นมหาวิทยาลัยเอกเทศและได้รับพระราชทานนามว่า “มหาวิทยาลัยนเรศวร" ดังนั้น คณะมนุษยศาสตร์ จึงมีประวัติอันยาวนานโดยเริ่มตั้งแต่เมื่อวันที่ 28 มิถุนายน 2517 เป็นวันที่วิทยาลัยวิชาการศึกษาได้รับการยกฐานะเป็นมหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ วิทยาเขตพิษณุโลก ซึ่งเปิดบริการการเรียนการสอนในคณะศึกษาศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ คณะพลศึกษา คณะมนุษยศาสตร์ คณะสังคมศาสตร์และบัณฑิตวิทยาลัย
พ.ศ. 2517
วันที่ 28 มิถุนายน 2517 วิทยาลัยวิชาการศึกษาได้รับการยกฐานะเป็น มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ วิทยาเขตพิษณุโลก ซึ่งเปิดบริการการเรียนการสอน ประกอบด้วย คณะศึกษาศาสตร์ คณะวิทยาศาสตร์ คณะพลศึกษา คณะมนุษยศาสตร์ คณะสังคมศาสตร์ และบัณฑิตวิทยาลัย ในส่วนของวิทยาเขตพิษณุโลกนั้น คณะมนุษยศาสตร์ได้ร่วมกับคณะศึกษาศาสตร์ รับผิดชอบในการผลิตบัณฑิตทางการศึกษาในหลักสูตรการศึกษาบัณฑิต (กศ.บ.) สาขาวิชาภาษาไทย และสาขาวิชาภาษาอังกฤษ
พ.ศ. 2533 – 2538
ได้รับการยกฐานะเป็นมหาวิทยาลัยเอกเทศและได้รับพระราชทานนามว่า มหาวิทยาลัยนเรศวร จึงมีการรวมคณะมนุษยศาสตร์และคณะสังคมศาสตร์ เป็น คณะมนุษยศาสตร์ มีภาควิชาในสังกัดรวม 11 ภาควิชา คือ ภาควิชาภาษาตะวันตก ภาควิชาภาษาไทยและภาษาตะวันออก ภาควิชาภาษาศาสตร์ ภาควิชาศิลปะและวัฒนธรรม ภาควิชาดุริยางศาสตร์ ภาควิชาบรรณารักษศาสตร์ ภาควิชาประวัติศาสตร์ ภาควิชาภูมิศาสตร์ ภาควิชารัฐศาสตร์ ภาควิชาเศรษฐศาสตร์ และภาควิชาสังคมวิทยา ซึ่งต่อมาได้มีการแบ่งภาควิชาภาษาไทยและภาควิชาภาษาตะวันออก ออกเป็น 2 ภาควิชา คือ ภาควิชาภาษาไทย และภาควิชาภาษาตะวันออก ดังนั้น จึงทำให้มีภาควิชารวมเป็น 12 ภาควิชา สำหรับภาควิชาภาษาตะวันออกนั้น เปิดสอนวิชาภาษาญี่ปุ่นและภาษาจีนเป็นวิชาโทและวิชาเลือกเสรี เพื่อเตรียมการเปิดสอนวิชาเอกภาษาญี่ปุ่นและภาษาจีน ซึ่งเป็นวิชาเอกที่ตลาดต้องการ
คณะฯ จึงได้ขยายโอกาสทางการศึกษาไปยังจังหวัดพะเยา ตามนโยบายของมหาวิทยาลัย ซึ่งสอดคล้องกับนโยบายของรัฐบาลด้วยเช่นกัน ด้วยการเปิดสอนวิชาเอกภาษาอังกฤษ และการจัดการธุรกิจ
พ.ศ. 2539
มหาวิทยาลัยมีนโยบายให้คณะมนุษยศาสตร์ ทำการยุบรวมภาควิชาที่มีลักษณะวิชาใกล้เคียงกันเข้าด้วยกัน ดังนั้นจึงทำให้ในปัจจุบัน คณะมนุษยศาสตร์ มีภาควิชาเหลือเพียง 5 ภาควิชา ได้แก่ ภาควิชาภาษา ภาควิชามนุษยศาสตร์ ภาควิชาการสื่อสาร ภาควิชาสังคมศาสตร์ และภาควิชาพาณิชยศาสตร์
พ.ศ. 2546
สภามหาวิทยาลัยได้มีมติให้มีการยุบรวมคณะมนุษยศาสตร์เป็น คณะมนุษยศาสตร์ พร้อมยุบเลิกภาควิชาต่างๆ ทั้งหมด เหลือเพียงสำนักงานเลขานุการคณะ และให้ตั้งคณะใหม่ ขึ้นอีก 3 คณะ คือ คณะวิทยาการจัดการและสารสนเทศศาสตร์ คณะนิติศาสตร์ และคณะสังคมศาสตร์ ซึ่งในส่วน ของคณะมนุษยศาสตร์ ได้ดำเนินงานในรูปสาขาวิชามีทั้งสิ้น 10 สาขาวิชา ได้แก่ สาขาวิชาภาษาไทย สาขาวิชาภาษาอังกฤษ สาขาวิชาภาษาญี่ปุ่น สาขาวิชาภาษาจีน สาขาวิชาภาษาฝรั่งเศส สาขาวิชาภาษาพม่า สาขาวิชาภาษาศาสตร์ สาขาวิชานาฏศิลป์ไทย สาขาวิชาดุริยางคศาสตร์ไทย และสาขาวิชาดุริยางคศาสตร์สากล
พ.ศ. 2548
สภามหาวิทยาลัยนเรศวร ในคราวประชุมครั้งที่ 120 (4/2548) เมื่อวันที่ 24 กันยายน พ.ศ.2548 มีมติเห็นชอบโครงสร้างการแบ่งส่วนราชการของคณะมนุษยศาสตร์ ประกอบด้วย 1 สำนักงานเลขานุการคณะ และ 4 ภาควิชา คือ ภาควิชากาษาและคติชนวิทยาลัย ภาควิชาภาษาตะวันตก ภาควิชาภาษาตะวันออก และภาควิชาศิลปกรรมศาสตร์
พ.ศ. 2555
สภามหาวิทยาลัยได้มีมติให้คณะมนุษยศาสตร์มีการบริหารงานภายในคณะ ดังนี้ สำนักงานเลขานุการคณะ มีการบริหารงานภายใน ประกอบด้วย 6 งาน คือ งานธุรการ งานการเงินและพัสดุ งานนโยบายและแผน งานบริการการศึกษา งานกิจการนิสิตและศิษย์เก่าสัมพันธ์ และงานวิจัยและบริการวิชาการ ภาควิชามีการปรับโครงสร้างออกเป็น 9 ภาควิชา ดังนี้ ภาควิชาภาษาไทย ภาควิชาภาษาศาสตร์ ภาควรรณคดีและคติชนวิทยา ภาควิชาภาษาอังกฤษ ภาควิชาภาษาตะวันตก ภาควิชาภาษาตะวันออก ภาควิชาดนตรีวิทยา ภาควิชาศิลปะการแสดง และภาควิชาปรัชญาและศาสนา และศูนย์พม่าศึกษา
พ.ศ. 2558
ในคราวประชุมครั้งที่ 212 (10/2558) เมื่อวันที่ 1 พฤศจิกายน พ.ศ.2558 มีมติอนุมัติการปรับโครงสร้างของคณะมนุษยศาสตร์ โดยให้ยุบเลิกภาควิชาปรัชญาและศาสนา และอนุมัติโครงสร้างใหม่ ดังนี้ 1) ภาควิชาดนตรี 2) ภาควิชาภาษาตะวันตก 3) ภาควิชาภาษาตะวันออก 4) ภาควิชาภาษาไทย 5) ภาควิชาภาษาศาสตร์ 6) ภาควิชาภาษาอังกฤษ 7) ภาควิชาคติชนวิทยา ปรัชญา และศาสนา 8) ภาควิชาศิลปะการแสดง 9) สถานพัฒนาการเรียนรู้ภาษาเมียนมา 10) สำนักงานเลขานุการ
พ.ศ. 2561
ในคราวการประชุมครั้งที่ 252 (10/2561) เมื่อวันที่ 23 กันยายน 2561 มีมติอนุมัติการปรับโครงสร้างหน่วยงานระดับภาควิชาของคณะมนุษยศาสตร์ ดังนี้ 1) สำนักงานเลขานุการคณะ 2) ภาควิชาภาษาตะวันตก 3) ภาควิชาภาษาตะวันออก 4) ภาควิชาภาษาศาสตร์ คติชนวิทยา ปรัชญาและศาสนา 5) ภาควิชาดนตรี 6) ภาควิชาภาษาอังกฤษ 7) ภาควิชาภาษาไทย และ 8) ภาควิชาศิลปะการแสดง